二者的主要区别如下：

第一、产地不同：其中巴花产于非洲，南美洲，主产地为非洲的加蓬、喀麦隆，苏木亚科巴西花梨木本属约15种，其中11种分布于热带非洲，4种分布于热带南美洲；非洲花梨主产于热带非洲。

第二、外观不同：其中巴花的心边材区别明显，心材黄褐至红褐色，边材白色至浅黄白色，生长轮略明显，管孔在放大镜下明晰，略小至中，单独及少数短径列复管孔(2—4个)，管孔内常含深色沉积物，散生；而非洲花梨心边材区别不明显，木材黄褐色，具深浅相间的条纹。轴向薄壁组织丰富，傍管型。