菌包发酵的正确方法如下：

1. 将废弃的蘑菇棒粉碎。1公斤微生物菌液可以发酵200公斤的蘑菇渣。

2. 菌液兑水稀释。

3. 将菌液和物料混合均匀堆放。

4. 发酵过程中，可以适当加一些尿素以达到较好的软化效果。

需要注意的是，发酵时禁止用500公斤或一立方以下的物料做实验。