区别主要体现在以下几个方面：

外观与口感：麻辣烫的外观相对清淡，主要以骨汤麻辣烫为主，口感偏辣或者清汤。而冒菜的表面会覆盖一层麻椒和辣椒油，口味非常重且油腻，有多种口味选择，如酸甜辣、甜辣等。

制作方法：麻辣烫是火锅的变种，食材用竹签串好，然后放进滚烫的红汤中烫熟。而冒菜则是用笊篱将选好的食材盛着，放到锅里煮熟，然后盛到碗里，再舀一勺汤汁，加入各种调料制作而成。

用餐形式：麻辣烫介于正餐和快餐之间，可以慢慢享用。冒菜则是一种快餐食物，就餐速度快，适合快节奏的生活方式。

营养价值：麻辣烫的汤由于反复煮煮，其营养价值可能较低。而冒菜所使用的锅底是采用几十种珍贵的香料精心烹制，其汤底采用大骨头熬制而成，味道鲜美，不含防腐剂，因此就汤的卫生和营养价值而言，冒菜的营养价值可能更高。

配餐习惯：麻辣烫通常单独食用，而冒菜往往会配米饭一同入口。

综上所述，甘肃麻辣烫和冒菜在外观、口感、制作方法、用餐形式、营养价值以及配餐习惯等方面都存在显著差异。在选择时，可以根据自己的口味和需求进行挑选。