4060显卡两风扇和三风扇的主要区别在于散热效果、性能和噪音。以下为具体区别：

1. 散热效果：三风扇显卡比两风扇显卡多一个风扇，因此散热能力更强。对于高性能显卡来说，良好的散热能力可以保证显卡在较高负载下保持稳定工作，降低显卡过热导致性能下降的风险。

2. 性能：理论上，增加一个风扇意味着功耗更大，性能更强。因此，三风扇显卡在功耗和性能方面可能略优于两风扇显卡。但需要注意的是，这并非绝对，实际性能差异可能并不显著，因为显卡的性能受到多种因素影响，如核心频率、显存容量等。

3. 噪音：在风扇型号相同的情况下，三风扇显卡的风扇数量更多，理论上噪音会相对较大。然而，实际噪音表现取决于风扇的静音设计和厂商的调校。有些三风扇显卡在保证良好散热的同时，也能实现较低的噪音。

总之，4060显卡两风扇和三风扇在散热效果、性能和噪音方面存在一定差异。选择时，可以根据个人需求和预算来决定。如果散热性能是关键因素，可以选择三风扇显卡；如果关注噪音和性能差异不大的情况下，两风扇显卡也是一个不错的选择。