厦门医保在上海的报销比例因医疗机构的等级和用药范围等因素而有所不同。

一般来说，如果是在一级医疗机构就医，报销比例为90%，二级医疗机构的报销比例为85%，三级医疗机构的报销比例有可能会降低10%左右。同时，医保也有一定的自费费用清单，不在医保目录的药品费用等是不可以报销的。

如果有具体就医情况，可以咨询参保地所在的医保中心，以获取更准确的信息。