将剥好的瓜子仁放入干燥的容器中存放，且要避免容器里有空气。

因为潮湿的环境容易导致瓜子仁发霉，容器里的空气也会让瓜子仁吸收潮气，所以要选用干燥的容器，并将容器密封好。

同时，如果条件允许，还可以在存放时放一些干燥剂来吸收周围的潮气。

另外，避免阳光直接照射瓜子仁，以防瓜子仁变质。