将僵尸毁灭工程服务器改成D盘的方法如下：

首先，先将服务器连接到电脑上，然后打开控制面板，找到“管理员工具”，再打开“计算机管理”，选中“磁盘管理”，找到原服务器所在的磁盘，右键选中“更改驱动器号和路径”，选中“添加”，选择D盘作为新的驱动器路径，点击“确定”即可。

修改完成后，需要重新启动服务器，使其能够正确地读取D盘上的文件和数据。