对水中细菌总数的测定通常主要测定以大肠杆菌为代表的肠道菌群。这是因为肠道菌群是一类广泛存在于自然界中，与人和动物肠道密切相关的细菌群落，是较易引起污染和疾病的细菌之一。

因此，在水质检测中，通过测定肠道菌群总数来判断水中是否存在污染源，从而采取相应的治理措施，确保饮用水的健康安全。

除了大肠杆菌外，还可通过测定其他厌氧菌数量、总腐生菌群和埃希菌等细菌群落来全面评估水质。