舟山洁净室净化车间主要分为细菌净化车间、空气净化车间、水净化车间、化学品净化车间等不同类型。

细菌净化车间主要用于生物制品、药品等的生产制备；空气净化车间则参与电子、仪器等行业，防止无菌环境对生产有影响；水净化车间主要用于饮用水、制药工程中；化学品净化车间承担着化学制品生产安全。舟山洁净室工程在不同行业应用广泛，净化车间也因应不同需求有所变化。