亚甲基蓝可以直接放入鱼缸中。它具有杀菌、杀虫的作用，并能解决真菌性水霉问题，常用于治疗各种鱼病。由于亚甲基蓝的毒性相对较弱，它被认为是相对安全的。如果鱼缸中的大部分鱼类都生病了，可以直接将亚甲基蓝投入鱼缸中。使用药物后，应注意一周后换水，以慢慢改善水质。然而，如果鱼缸中只有少数鱼类生病，通常不建议直接将药物投入鱼缸中。
在这种情况下，可以准备一个单独的药浴池，将生病的鱼浸泡约20分钟后再放回鱼缸中