有区别，区别在于，功能基因组学和表观遗传学是两个相互关联但有所区别的领域。

功能基因组学主要研究基因或蛋白质的功能，通过高通量的实验方法，如基因敲除、基因过表达、RNA干扰等，来探究基因在生物体中的具体作用。它侧重于基因的表达调控、信号转导、代谢途径等方面，以揭示基因如何影响生物体的表型。

而表观遗传学则研究不涉及DNA序列改变的基因表达调控，主要关注DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA等非遗传信息的传递和调控机制。它探究的是生物体在发育和适应环境过程中，如何在不改变DNA序列的情况下，实现基因表达的时空特异性。

总的来说，功能基因组学更注重基因或蛋白质的功能研究，而表观遗传学则更侧重于非遗传信息的传递和调控机制。两者相辅相成，共同推动了对生命现象深入理解的进程。