存在一些区别。这些区别主要体现在以下几个方面：

药品供应：医院和药店的药品供应可能有所不同。医院通常拥有更全面的药品库存，可以满足各种慢性病的治疗需求。而药店的药品供应可能受到一些限制，可能无法提供所有类型的慢性病药品。

价格：在医院购买药品时，药品价格通常按照政府规定的价格执行，价格相对稳定。而在药店购买药品时，价格可能会受到市场供需关系、品牌等因素的影响，存在一定的浮动。

报销比例：使用慢性病卡在医院和药店购买药品时，医保报销比例可能有所不同。一般来说，在医保定点药店购买药品的报销比例可能会略低于在医院购买药品的报销比例。但具体报销比例还需根据当地医保政策来确定。