旋挖钻机在进行钻孔时，如果遇到卵石层，首先需要根据卵石层的厚度和分布情况做出相应的调整。如果卵石层较薄且分散，可以尝试进行钻孔，但是需要注意控制振动和旋转力度，避免损坏机器或设备。

如果卵石层较厚或密集，建议使用先进的钻头或其他工具进行卵石层破碎和清除，以确保正常钻孔。同时，还需要注意安全防范措施，如加装防护装置和保证现场安全等，以避免意外发生。