对于农村自建房来说，使用水泥作为基础比石头更加稳固和可靠。水泥具有很强的抗压强度和耐水性，可以有效地防止地基下沉等问题。而石头则容易被侵蚀和风化，长期使用会导致建筑物不稳定。此外，使用水泥还可以简化施工过程和提高建筑效率。因此，在农村自建房时，推荐使用水泥基础。