医保卡余额负数的处理方法如下账户余额为负数不需要转移。

只要你医保当月没有处于欠费状态，医保卡为负数也是可以结算的，医保卡在医院只是作为一个凭据，里面有钱了可以扣里面的钱，没有的话就直接支付，可以不用医保卡。需要定点单位的工作人员进行手动上传，才能使相关数据传输到中心数据库，再进行个人账户的冲减。