是违建。南京大学被指责将违建房屋出租给商户，涉及的合同纠纷牵出了一连串的问题。

这其中最引人关注的就是南京大学未能提供相关房屋的合法产权证明，而房产查询结果则显示这些房屋的土地用途为科教，房屋本身被认定为违建。违建房屋的存在引发了社会各界的关切。南京大学作为一所享誉全国的高校，其管理水平和规范程度一直备受质疑。一所高校涉及到违建问题，不仅仅是一场合同纠纷那么简单，更是牵涉到了大学管理和社会责任的重要议题。