在闲鱼中，按距离估算运费公斤的设置方式如下：

首先，进入卖家中心，选择“价格管理”下的“运费模板”选项。

然后，选择需要设置的模板，进入“运费设置”界面。

在这个界面中，可以选择“按距离估算”选项，并设置相应的基础运费和首重价、续重价等参数。

最后，点击“保存”按钮即可完成设置。值得注意的是，闲鱼按距离估算运费公斤的计算方式为实际距离乘以单位距离的运费。因此，在设置运费模板时，需要考虑到运输成本和市场价格，从而达到一个合理的运费标准，既不会让买家感到贵，也不会让卖家亏本。