金辉鹿鸣长滩一次仅盖两栋楼的原因可能有以下几点：

首先，该项目可能采用了分期建设的策略，以逐步推进工程进度，避免一次性投入过多资源和人力。

其次，考虑到市场需求和销售情况，开发商可能会根据首批楼栋的销售情况来决定后续楼栋的建设速度。此外，项目规划和土地使用权也可能对建筑数量有所限制。

最后，建筑施工过程中可能会受到诸如天气、材料供应等因素的影响，为确保工程质量和进度，开发商可能会合理安排施工节奏。总之，金辉鹿鸣长滩一次仅盖两栋楼可能是多种因素共同作用的结果。