会。因为所有的银行最终都是会汇总进人民银行的反洗钱系统的,并且50万人民币存入银行会触发反洗钱系统的。一般来说,如果你是通过转账的方式存入银行,转账记录会记载你的资金来源,这样监管机构会很容易追踪到你的资金来源和去向。

如果是平常账户流水比较多的情况下,普通人一次存50万块钱,正常的情况下是不会被查的,只要你没有触犯法律,不是嫌疑人,正当收入得来的都没事儿。