不建议将亚甲基蓝和硝化细菌一起放。亚甲基蓝是一种消毒剂，可以杀灭水中的细菌和病毒，而硝化细菌则是一种有益菌，可以帮助净化水质。如果将亚甲基蓝和硝化细菌一起放入鱼缸中，可能会对硝化细菌造成伤害，甚至可能导致水质恶化。因此，建议在使用亚甲基蓝消毒后，等待一段时间再加入硝化细菌。