疾控中心在元旦假期期间是否上班，取决于该中心的运营政策和当地公共卫生事件的需求。通常情况下，元旦是公共假期，大部分机构会安排休假。但是，疾控中心作为公共卫生体系的重要组成部分，可能会根据实际情况调整休假安排，以确保在紧急情况下能够及时响应。

在某些情况下，疾控中心可能会在元旦期间保持部分员工值班，以应对突发的公共卫生事件。此外，一些疾控中心可能会根据当地疫情或其他公共卫生需求，调整假期安排，以确保关键工作的正常进行。

因此，要确定疾控中心元旦是否上班，最好直接联系该中心或查询其官方网站，以获取最准确的信息。