1 不会影响40.50报销。

2 社保局系统升级交不了会影响40.50报销的原因是，社保局系统升级只是影响了交费的流程，与报销无关。

40.50报销是根据具体的医疗费用和个人社保账户余额进行结算，与系统升级无关。

3 因此，社保局系统升级交不了不会影响40.50报销，只需要在系统升级完成后按照正常流程进行报销即可。