香港夫妻办理探亲证需要在深圳市出入境管理机构进行申请，并取得《中华人民共和国往来港澳通行证》或《中华人民共和国旅行证》。具体办理流程如下：

1.登录广东省公安厅出入境政务服务网、深圳市公安局出入境便民网或“深圳出入境”微信公众服务号，按要求逐项填写后，提交夫妻类探亲签注申请，获取网上受理回执号。

2.7个工作日后，凭受理回执号上网查询审批结果。选择到公安机关领取证件的，持往来港澳通行证自行前往市公安局出入境管理局受理大厅办理相关手续。如选择速递的，等候速递公司上门收取往来港澳通行证及办证费用。

需要注意的是，申请人在申请前需确认自己是否符合办理条件，具体要求可咨询当地出入境管理机构。