《周哲予与顾菀尔》小说结局是两人最终分手了。在经历了种种波折和考验之后，周哲予和顾菀尔明白彼此的人生轨迹已经趋于分离，他们最终选择了各自的道路。尽管他们之间的感情深厚，但是现实和未来的不确定性让他们不得不做出这样的决定。这个结局让人感到有些遗憾，但同时也展现了人生中不同阶段的选择和嬗变。