对于40万20年商贷和公积金贷款，其利息的高低取决于当前市场利率和贷款机构的政策。一般来说，商业贷款的利率相对较高，而公积金贷款的利率相对较低。

如果假定商业贷款利率为5%，公积金贷款利率为3.25%，则40万20年商贷的总利息将高出公积金贷款约10万元左右。因此，对于需要借款的人来说，应该仔细比较不同贷款机构的利率和政策，选择最优惠的方案。