不合理。

因为理论上，医保报销应该根据实际花费进行报销。

如果确实是大病治疗花费了12万，那么医保应该按照规定比例进行报销，而不是只报销三千元。

如果此次报销确实存在问题，可以向相关部门申诉。

另外，在这样的情况下，建议购买商业医保，以避免类似问题的发生。