不报销。 新生儿益生菌一般不是医院报销项目之一，因为它属于保健品或营养品范畴，而不是治疗性药品。不过，具体是否可以报销要根据不同地区和不同的医保政策而定。

在一些地区，新生儿出生后可能会有一些常规的体检项目，其中可能包括益生菌的检测和使用，这些项目可能可以报销一部分费用。