根据一般的施工要求，通常需要在填充后等待水泥充分凝固和干燥，一般需要等待28天左右才能进行防水处理。虽然有快干水泥等特殊材料可以缩短时间，但为了确保防水效果，通常还是需要等待至少7天以上。因此，仅仅等待三天后进行防水处理是不够的。防水处理需要在基层充分凝固和干燥的情况下进行，以确保防水材料的附着力和防水效果。

因此，建议在填充后至少等待7天以上，才进行防水处理，以确保工程质量和安全性。