如果大学新生在军训体检中被发现怀孕，首先应该保持冷静。她可以与医生或学校相关部门进行私下沟通，了解相关政策和程序。根据学校规定，她可能需要提供相关证明材料，并与学校协商解决方案。

学校可能会提供适当的支持和帮助，例如调整训练计划或提供咨询服务。同时，她也可以与家人、朋友或专业机构寻求支持和建议，以便做出最合适的决策。

最重要的是，她应该保护自己的身体和心理健康，并根据自己的情况做出明智的选择。