海关登记证书申请流程如下

1. 材料准备齐全，交经办人员审核。审核通过后，由经办人员给十位海关编码；

2. 拿到十位编码后，自行将材料送往贵阳海关二楼数据分中心进行数据录入，并刻制报关专用章（尺寸50mm36mm）（样板由经办人员提供）；

3. 数据录入完毕，报关专用章刻好后，将材料及章带回交经办人员办理。