1、服务航班区别：T1（昆明长水国际机场第一航站楼）主要为国内和部分国际航班提供服务。是较早建成的一个综合性客运大楼，具备现代化设施和便利的乘机条件。T2（昆明长水国际机场第二航站楼）则专门用于处理更多的国内和部分区域性航班。是近年来扩建并投入使用的新型客运大厦，提供了更加先进、高效、便捷的乘机体验。
2、设施与规模区别：T1拥有较多餐饮店铺、商店以及其他旅行相关设施，还配备了候车休息区、贵宾厅等。作为老牌终端建筑之一，T1在规模上较小。T2在设计上更加现代化，空间布局宽敞明亮。商业资源也得到充分发展，在购物娱乐等方面提供了更多选择。