农村大病二次报销是在当地的社保部门进行的。具体来说，农村居民大病保险是由各地的财政部门与社保部门共同实施的，农村居民在购买医保后，可以享受大病保险的报销。

在出现大病需要向医院进行治疗时，如果医保已经报销完了，那么农村居民可以再次向社保部门进行报销，这就是所谓的大病二次报销。

一般来说，社保部门会要求农村居民提供相应的医疗证明和报销单据，然后在规定的时间内进行审核和处理，最终将报销款项退还给申请人。因此，如果您需要进行农村大病二次报销，建议您先咨询当地社保部门的相关政策和流程，然后按照规定的步骤进行办理，以便更快地得到相应的报销款项。