医保互助共济的扣款方式如下：

共济人先行垫付：在需要就医时，先自行支付医疗费用。

提交费用凭证：将就医所需的发票、报销单等费用凭证提交给共济基金管理人员。

审核与结算：共济基金管理人员审核费用凭证的真实性和合理性，并进行费用结算。

扣除共济基金：共济基金管理人员将已结算的费用从共济基金中扣除，并将剩余的共济基金余额进行管理和维护。

需要注意的是，医保共济仅仅共济的是医保个人账户的余额，医保统筹基金账户的钱是无法共济报销的。