金光瑶和秦愫是兄妹的原因在于他们共同的父亲金光善。在《魔道祖师》及其衍生作品中，金光善是金光家族的家主，拥有多重身份和复杂的人际关系。秦愫是金光善的私生女，而金光瑶则是金光善的私生子。由于他们都是金光善的子女，因此按照血缘关系，他们是兄妹。

金光瑶和秦愫的兄妹身份在故事中起到了重要的作用。他们之间的关系揭示了金光家族内部的权力斗争和家族纷争，也展现了人性的复杂性和多面性。同时，他们之间的互动和情感纠葛也为故事增添了更多的戏剧性和张力。